基于最短路径法重建染色体三维结构
摘 要
染色体三维结构重建是近些年表现遗传和基因组学的研究热点，它通常也被称为染色体三维结构预测问题，是指根据染色体的交互频率数据，预测其在三维空间的结构。研究表明染色体三维空间结构在生物基因表达、调控等方面都发挥着重大作用。随着染色体构象捕获技术及其衍生技术的发展,特别是全基因组范围内捕获染色质交互的Hi-C技术的出现,目前已获得大量的染色质二维接触频率数据。如何利用计算技术和生物信息技术预测染色体三维结构已成为三维基因组学研究的核心问题。目前存有的重构算法主要有两种
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